肾结石属于上尿路结石，常发生在肾盏，增大后延伸到肾盂、输尿管和膀胱。结石比较大的时候会造成肾盏颈部的梗阻，引起积液积脓，形成肾实质的萎缩、瘢痕、肾周围脓肿。
当结石在经过生理狭窄处时，会造成急性、完全型和不完全型的尿路梗阻，造成肾积水，导致肾功能受损。情况严重的会出现无尿，进入尿毒症期，这时就需要血液透析来维持生命。有的结石会在肾盏形成鹿角结石甚至充满肾盏，只能通过手术取石。除此之外，结石还易发生感染，少数病例有恶变的风险。
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