视神经萎缩是临床上很多疾病终末期的一种眼底表现。首先，视神经炎又分为多种亚型，如视神经脊髓炎、脱髓鞘性视神经病变包括一些多发性硬化以及免疫相关性的视神经炎，它们后期都可以出现视神经萎缩。除了炎症以外，由于肿瘤的压迫、浸润，在中晚期就可以出现视神经的萎缩；其次，遗传因素如常染色体显性遗传视神经病变，Leber遗传性视神经病变后期也能引发视神经萎缩。
临床常见的中毒及营养障碍型视神经萎缩也是较多见的。如药物中毒，以治疗结核病的乙胺丁醇、某些抗肿瘤药物所导致中毒为主。有毒试剂、重金属中毒可引发视神经病变，烟酒中毒性视神经病变后可出现视神经萎缩，大术后突然出现的亏气亏血常常可以合并视神经萎缩。研究还证实，青光眼的后期可以出现视神经萎缩。
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