临床上对于视神经萎缩患者的检查除了常规的裂隙灯、眼底镜可以观察患者的瞳孔情况，视神经乳头的颜色、边界等情况，以及整个视网膜神经纤维层有无异常的改变的情况。专业的检查仪器设备更好的对患者的视力、视野、对比敏感度和色觉进行相应检查。比较常用的是视神经生理OCT，对于眼底疾病有很好的诊断作用。荧光血管造影检查视乳头是否有充盈、水肿、渗漏等情况，是否合并视网膜病变有较高的诊断价值。眼科医生常做的是检查视力视野、电生理OCT以及对比敏感度和素洁检查。
神经病变患者在相对比较早期时，医生怀疑是否是颅内病变激发的视神经萎缩，可以加查头颅的核磁、CT，或MRA、MRV的相关一系列的检查来排除诊断。
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