克罗恩病的发病部位的话，主要是可以在全消化道，包括从口腔到食管，十二指肠，小肠，再到结肠，他每个部位都是有可能会发生病变的，而溃疡性结肠炎的话，发病部位主要是以直肠，乙状结肠为主，也可以伴有这种全结肠型的一个改变。
在临床症状方面表现，克罗恩病的话主要是以腹泻，腹痛为主，但溃疡性结肠炎除了腹泻腹痛，他最主要的表现还有这种黏液脓血便，在这个结肠镜下的话，溃疡性结肠炎是以这种连续性的一个粘膜的糜烂，溃疡为主，而克罗恩病在结肠镜下主要是以这种截断形的一个纵行溃疡为主，可以是这种跳跃性，而且在克罗恩病的话，他时常会伴有这种瘘或者是肠形狭窄这样一些改变，但是对于溃疡性结肠炎他很少发生上述的一些改变。
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